Ключавая розніца - AFLP супраць RFLP

Даследаванні ДНК маюць велізарнае значэнне для разумення і вызначэння філагенетычных сувязяў, дыягностыкі генетычных захворванняў і адлюстравання геномаў арганізма. Некалькі метадаў, звязаных з аналізам ДНК, таксама выкарыстоўваюцца для ідэнтыфікацыі пэўнага гена ці паслядоўнасці ДНК у пуле невядомай ДНК. Яны вядомыя як малекулярныя маркеры. Палімарфізм даўжыні ўзмоцненага фрагмента (AFLP) і палімарфізм даўжыні фрагмента (RFLP) - гэта два такія малекулярныя маркеры (метады), распрацаваныя ў малекулярнай біялогіі для выяўлення генетычнай змены паміж арганізмамі. Абодва спосабу аднолькава важныя і маюць перавагі і недахопы. Ключавая розніца паміж AFLP і RFLP заключаецца ў тым, што AFLP ўключае ў сябе селектыўную ПЦР-ампліфікацыю пераваранай ДНК, у той час як RFLP не прадугледжвае селектыўную ампліфікацыю фрагментаў ДНК.

СОДЕРЖАНИЕ 1. Агляд і ключавая розніца 2. Што такое AFLP 3. Што такое RFLP 4. Паралельнае параўнанне - AFLP супраць RFLP 5. Рэзюмэ

Што такое AFLP?

AFLP (Паліморфізм даўжыні ўзмоцненага фрагмента) з'яўляецца важным інструментам у малекулярнай біялогіі і шырока выкарыстоўваецца ў аналізе генетычных варыяцый. AFLP заснаваны на спецыфічнай ПЦР-ампліфікацыі фрагментаванай геномнай ДНК і выяўленні палімарфізму пры дапамозе аўтарадыёграфаў пры дапамозе гель-электрафарэзу. AFLP шырока спрыяе выяўленню генетычных адрозненняў у штамах ці цесна звязаных відах розных каралеўстваў, уключаючы расліны, жывёлы, бактэрыі і грыбы. AFLP можа ажыццяўляцца з невялікай колькасцю невядомых узораў ДНК. Не патрабуецца папярэдняе веданне паслядоўнасці і праектаванне зондаў.

Крокі AFLP


  1. Вылучэнне расшчаплення ДНК ДНК з абмежаваннем эндануклеазамі Звязванне фрагментаў абмежаванай ДНК з адаптарамі Селектыўная ампліфікацыя фрагментаў з пэўнымі сайтамі абмежавання Падзел прадуктаў ПЦР гель-электрафарэзам Візуалізацыя гелевай матрыцы з дапамогай аўтарадыёграфа

AFLP - больш адчувальны і ўзнаўляемы метад, які можа быць выкарыстаны ў прафіляванні ДНК некалькіх таксонаў, уключаючы грыбы, бактэрыі, расліны і жывёл без папярэдняга ведама паслядоўнасцей ДНК. Гэта дапамагае выявіць невялікія адрозненні сярод асоб у папуляцыі з-за яго вельмі адчувальнай прыроды. AFLP таксама важны ў генаграфічным картаграфіі, судовых даследаваннях, бацькоўскім тэсціраванні, генатыпізацыі і г.д.

Што такое RFLP?

Палімарфізмы з абмежаваннем даўжыні фрагмента (RFLP) - гэта метад, які выкарыстоўваецца для выяўлення генетычных змен у гамалагічных паслядоўнасцях ДНК. Гэта першы метад, распрацаваны для прафілявання ДНК. Арганізмы маюць унікальныя адбіткі ДНК або профілі ДНК. RFLP служыць важным інструментам аналізу варыяцый паміж ДНК-профілямі внутривидовых ці цесна звязаных арганізмаў, паколькі гамалагічныя паслядоўнасці маюць розныя сайты (месцы) абмежавання, характэрныя для пэўнага арганізма. Калі гамалагічная ДНК засвойваецца з пэўным абмежаваннем эндануклеаз, гэта прывядзе да розных ДНК-профіляў, унікальных для кожнага чалавека. Такім чынам, галоўным у гэтым метадзе з'яўляецца выяўленне генетычнай змены сярод арганізмаў шляхам абмежавання гамалагічнай ДНК спецыфічнымі рестрикционными ферментамі і аналіз палімарфізму даўжыні фрагмента з дапамогай гель-электрафарэзу і прамакання. Заканамернасць пігментацыі унікальная для кожнага арганізма і характарызуе пэўныя генатыпы.

Крокі RFLP

  1. Вылучэнне дастатковай колькасці ДНК з узораў Фрагментацыя узораў ДНК са спецыфічным абмежаваннем эндануклеаз на кароткую паслядоўнасць Падзел атрыманых фрагментаў рознай даўжыні электрафарэзам з агарозным гелем. Перанос гель-профіля ў мембрану шляхам прамакання Саузерна Гібрыдызацыя мембраны з мечанымі зондамі і аналіз палімарфізму даўжыні фрагмента ў кожным профілі

RFLP з'яўляецца вельмі важнай методыкай выяўлення спадчыны хваробы і пошуку рызыкі ўзнікнення хваробы сярод членаў сям'і. RFLP таксама часта выкарыстоўваецца ў генаграфічным адлюстраванні, выяўленні злачынцаў у судовай экспертызе, выпрабаванні бацькоўства і г.д. RFLP таксама мае шэраг абмежаванняў. RFLP патрабуе папярэдняга ведання паслядоўнасці дадзеных для праектавання зондаў для гібрыдызацыі. Таксама патрабуецца вылучэнне дастатковай колькасці ДНК з пробы для аналізу, што складана пры судовых даследаваннях.

У чым розніца паміж AFLP і RFLP?

Рэзюмэ - AFLP супраць RFLP

AFLP і RFLP - гэта дзве методыкі, якія выкарыстоўваюцца ў якасці генетычных маркераў для ацэнкі разнастайнасці і ацэнкі генетычных сувязей у малекулярнай біялогіі. AFLP служыць больш эфектыўным і адчувальным метадам выяўлення генетычнага палімарфізму паміж арганізмамі, чым RFLP. Аднак, хаця абодва гэтыя метаду адрозніваюцца эфектыўнасцю ў выяўленні генетычных варыяцый, яны ўсё яшчэ выкарыстоўваюцца для адбіткаў пальцаў ДНК і дыягностыкі захворвання.

Даведка: `1. Гарсія, Антоніа Ф., Лусіяна Л. Бенхімол, Антонія М. М. Барбоса, Ісаяс О. Геральдзі, малодшы Суза Клаўдыё Л. і Анета П. Дэ Суза. "Параўнанне маркераў RAPD, RFLP, AFLP і SSR для даследаванняў разнастайнасці ў трапляючых трапічных лініях кукурузы." Генетыка і малекулярная біялогія. Sociedade Brasileira de Genética, 2004. Павуцінне. 19 сакавіка 2017 г. 2. "Палімарфізм даўжыні фрагмента абмежавання (RFLP)." Нацыянальны цэнтр інфармацыі па біятэхналогіі. Нацыянальная медыцынская бібліятэка ЗША, Інтэрнэт. 19 сакавіка 2017 г. 3. Масіга Д. К. і Тэрнер CM (2004 г.). "Узмацненне (абмежаванне) фрагмента палімарфізму на даўжыню фрагмента (AFLP)". Метады Mol Biol: 270: 173-86. NCBI. Павуцінне. 19 сакавіка 2017 г.

Здымкі: 1. "ALFP" Барбароса з Галандскай Вікіпедыі - Пераведзены з nl.wikipedia у Вікісховішча. (Public Domain) праз Wikimedia Commons 2. "RFLP адлюстраванне" Аўтар Retama - Свая праца (GFDL) праз Wikimedia Commons