Ключавое адрозненне электрафарэзу геля паміж двумерным і двухмерным гелем заключаецца ў уласцівасцях, якія выкарыстоўваюцца для падзелу бялкоў на гель-электрафарэз. 1D гель-электрафарэз аддзяляе толькі вавёркі на аснове малекулярнай масы, у той час як 2D гель-электрафарэз аддзяляе вавёркі на аснове яго электрычнай кропкі і малекулярнай масы.

Падзел бялку метадам гель-электрафарэзу - важная тэхніка характарыстыкі бялкоў. Вавёркі валодаюць рознымі ўласцівасцямі; такім чынам, падзел больш складаны ў параўнанні з аддзяленнем ДНК электрафарэзам гелем Агарозы.

СОДЕРЖАНИЕ

1. Агляд і ключавая розніца
2. Што такое 1D гелевы электрафарэз
3. Што такое 2D гелевы электрафарэз
4. Падабенства паміж 1D і 2D гелевым электрафарэзам
5. Паралельнае параўнанне - электрафарэз геля 1D супраць 2D геля ў таблічнай форме
6. Рэзюмэ

Што такое 1D гелевы электрафарэз?

1D гелевы электрафарэз, таксама вядомы як генальны электрафарэз аднаго вымярэння, - гэта метад падзелу бялку, заснаваны на малекулярнай масе. Аддзяленне бялку ў асноўным адбываецца з выкарыстаннем электрафарэзу геля для поліакрыламіду. Грунтуючыся на канцэпцыі гель-электрафарэзу, малекулы раздзяляюць па ўласцівасці малекулярную масу і зарада.

Такім чынам, каб надаць вавёркам раўнамерную апрацоўку, даэцылавы сульфат натрыю (SDS) праводзяць да гель-электрафарэзу. SDS дэнатуіруе вавёркі і забяспечвае раўнамерны адмоўны зарад на бялку; калі адбываецца прымяненне электрычнага поля, вавёркі мігруюць да станоўчага тэрмінала ў залежнасці ад іх малекулярнай масы. Такім чынам, пры падзеле разглядаецца толькі адно ўласцівасць. Менавіта таму гэты метад называюць 1D гель-электрафарэзам.

Падчас 1D гель-электрафарэзу вавёркі аддзяляюцца ў залежнасці ад іх малекулярнай масы. У сувязі з гэтым малекулы меншага вагі хутчэй мігруюць у гелі ў параўнанні з вавёркамі з высокай малекулярнай масай. Такім чынам, вавёркі з высокай вагой застаюцца побач з лункамі.

Што такое 2D гелевы электрафарэз?

Двухмерны гель-электрафарэз або двухмерны гель-электрафарэз падзяляе вавёркі на аснове двух уласцівасцей. Дзве ўласцівасці - ізаэлектрычная кропка бялку і малекулярная маса. Гэты метад падзелу бялку павялічвае дазвол аддзялення бялку. Ізаэлектрычная кропка бялку залежыць ад pH, пры якім бялок нейтральны.

Такім чынам, пры электрафарэзе ў 2D гелі бялку дазваляецца працаваць па фіксаваным градыенце рН у першым вымярэнні. У другім вымярэнні вавёркі аддзяляюць пры дапамозе вертыкальнага або гарызантальнага электрафарэзу геля электрафарэзу. Такім чынам, вавёркі падзеляцца ў залежнасці ад іх малекулярнай масы ў другім вымярэнні.

Акрамя таго, гэты метад гель-электрафарэзу павышае дазвол аддзялення бялку. Такім чынам, падзеленыя вавёркі чысцейшыя. Аднак кошт тэхнікі нашмат вышэй, чым гель-электрафарэз аднаго вымярэння.

У чым падабенства паміж 1D і 2D гелевым электрафарэзам?


  • Абедзве методыкі падзяляюць вавёркі.
    Такім чынам, яны важныя пры характарыстыцы бялкоў.

У чым розніца паміж 1D і 2D гелевым электрафарэзам?

Ключавое адрозненне электрафарэзу геля паміж двумерным і двухмерным гелем заключаецца ў тым, што электрафарэз геля 1D аддзяляе вавёркі толькі на малекулярнай масе, у той час як 2D гель-электрафарэз раздзяляе вавёркі на аснове як электрычнай кропкі, так і малекулярнай масы. З-за гэтай асноўнай розніцы паміж электрафарэзам геля 1D і 2D, дазвол аддзялення бялкоў і кошт гэтых двух метадаў таксама змяняюцца. 2D гель-электрафарэз паказвае больш высокае дазвол, чым 1D гель-электрафарэз. Аднак 2D гель-электрафарэз каштуе даражэй, чым 1D гель-электрафарэз.

Ніжэй у інфаграфіцы абагульнена розніца паміж 1D і 2D гель-электрафарэзам.

Розніца паміж 1D і 2D гелевым электрафарэзам ў таблічнай форме

Рэзюмэ - 1D супраць 2D гель-электрафарэз

Падзел бялкоў залежыць ад многіх фактараў. 1D гель электрафарэз аддзяляе вавёркі на аснове толькі малекулярнай масы. Аднак двухмерны або двухмерны гель-электрафарэз павялічвае дазвол аддзялення бялку. Далей 2D гель-электрафарэз аддзяляе вавёркі на аснове ізаэлектрычнай кропкі і малекулярнай масы. Такім чынам, гэтыя дадзеныя важныя для наступнай апрацоўкі бялкоў і ў галіне пратэёмікі. Такім чынам, гэта рэзюмэ розніцы паміж 1D і 2D гель-электрафарэзам.

Даведка:

1. Галева, Надзея і Міхаіл Альтэрман. "Параўнанне аднамернага і двухмернага гель-электрафарэзу як інструмент падзелу для пратэямічнага аналізу мікрасомы печані пацукоў: Цитохромы Р450 і іншыя мембранныя бялкі".

Здымкі:

1. "Электрафарэз - запаўненне 1D гелевых лунак сумессю бялкоў" Жан-Эцьен Пуарые - Напаўненне 1D гелевых лунак сумессю бялкоў (CC BY-SA 2.0) праз Wikimedia Commons
2. "2D электрафарэз" Нацыянальнага інстытута здароўя - Цэнтра даследаванняў рака нанабіёлагаў, Нацыянальнага інстытута здароўя (грамадскае здабытак) праз Вікісховішча